نعم، هناك العديد من الأدوات المستخدمة في هندسة النظم البيئية، ومنها:
1- برامج نمذجة الأنظمة البيئية.
2- أدوات التحليل الإحصائي والرسم البياني.
3- برامج تحويل البيانات والتحليل المالي.
4- أجهزة الاستشعار البيئي وأجهزة القياس والتحليل.
5- أجهزة المراقبة البيئية وأجهزة الفحص والاختبار.
6- البرمجيات الخاصة بتحليل بيانات المراقبة البيئية.
7- الأدوات المستخدمة لمعالجة النفايات وإعادة تدويرها.
8- أجهزة تحلية المياه المالحة وتنقية المياه والهواء.
9- الأجهزة والمعدات المستخدمة لإعادة تأهيل الأراضي الملوثة.