مناهج العثيمين في تفسير القرآن الكريم تعتمد على المنهج العلمي والعقلاني والمنطقي، وهي ترجع إلى القواعد الأصولية في التفسير والفقه الإسلامي. ويعتبر العثيمين من أشهر العلماء المعاصرين في تفسير القرآن الكريم، حيث تميز تفسيره بالبساطة والوضوح والعمق، كما استخدم في تفسيره عدة أساليب ومناهج منها:
1- الاستدلال بالآيات الأخرى وتفسير القرآن بالقرآن.
2- الاستدلال بالسنة النبوية كما يعتمد على تفسير القرآن بالسنة.
3- الاستدلال باللغة العربية والنحو العربي والبلاغة العربية.
4- استخدام المقارنة بين مختلف الآيات والسور في تحليل الموضوع.
5- الاستدلال بالتاريخ والسياق الاجتماعي للآية.
ويهدف العثيمين في تفسيره إلى تفهم المعنى الحقيقي للآيات القرآنية وتطبيقها على أرض الواقع، ويركز في تفسيره على الأهداف الإيمانية والأخلاقية والتربوية والعقائدية التي يرمي إليها القرآن الكريم.