توجد العديد من مشاكل الحوسبة الشخصية، ومنها:
1- الفيروسات والبرامج الضارة: وهي برامج تهدف إلى التلف والضرر بالأنظمة الحاسوبية، وقد تؤثر على البيانات وتسرق المعلومات الشخصية.
2- الأعطال التقنية: وهي المشاكل التي قد تحدث بشكل عفوي، مثل تعطل الجهاز أو البرامج، أو أخطاء النظام.
3- نقص الموارد: وهي المشاكل التي تحصل نتيجة نقص الموارد الضرورية مثل الذاكرة والمساحة التخزينية.
4- عدم الاستخدام الصحيح للحوسبة: وهي المشاكل التي تحصل نتيجة عدم الوعي والخبرة الكافية في استخدام الأجهزة والبرامج.
5- الاختراقات الأمنية: وهي استغلال الثغرات الأمنية في البرامج والنظام للوصول إلى المعلومات الشخصية للمستخدمين.
6- التعارض بين البرامج: وهي المشكلة التي تحدث نتيجة تعارض بعض البرامج مع بعضها البعض وتسبب في اضطراب النظام.
7- ارتفاع تكلفة الحوسبة: وهي المشاكل المالية التي تحدث نتيجة تكاليف شراء وصيانة الأجهزة والبرامج.