تواجه إدارة الإنتاج الصناعي العديد من المشاكل التي يجب معالجتها لتحقيق الأداء الأمثل، ومن أهم تلك المشاكل:
1- التخطيط السيئ: وهو عدم وجود خطة محددة لإنتاج المنتجات أو تخطيط غير كافٍ لمتطلبات المنتج.
2- سوء التنسيق بين الإدارات: وهو عدم التنسيق بين الإدارات المختلفة في الشركة مثل الإنتاج والمبيعات والتسويق والمشتريات.
3- ضعف الجودة: وهو عدم وجود معايير جودة محددة أو عدم الالتزام بها.
4- تكاليف الإنتاج الزائدة: وهو تكلفة إنتاج المنتجات التي تزيد عن التكاليف المتوقعة.
5- نقص المواد الخام: وهو عدم توفر المواد اللازمة للإنتاج في الوقت المناسب.
6- تأخر التسليم: وهو عدم تسليم المنتجات في الوقت المتفق عليه.
7- عدم الإستجابة لتغييرات السوق: وهو عدم القدرة على التأقلم مع تغييرات السوق والطلب على المنتجات.