تطور الأجنة النباتية يمر عادة بثلاث مراحل رئيسية هي:
1- المرحلة الأولى: تبدأ عند التخصيب حيث يتم تكوين الجنين النباتي وتتكون من بذرة واحدة أو أكثر. وفي هذه المرحلة، تحتاج البذور إلى بقاءها في بيئة مناسبة للحفاظ على محتوياتها الغذائية وبطانة البذرة توفر الحماية اللازمة للجنين.
2- المرحلة الثانية: تبدأ بعد فترة من التخصيب وتعرف باسم المرحلة الأولية ويكون للجنين ثمرة وانبات. تمتد هذه المرحلة حتى تتكون الأوراق الأولية وتتطور الجذور.
3- المرحلة الثالثة: تعرف باسم المرحلة الثانوية وتحدث بعد تكوين الأوراق الأولية والجذور. خلال هذه المرحلة، تتطور بقية الأعضاء النباتية مثل السيقان والأوراق والزهور والثمر.