هناك بعض العيوب المحتملة لبرنامج نابستر عبر الإنترنت، منها:
1- بعض الملفات ذات الحجم الكبير يمكن أن تستغرق وقتًا طويلاً للتحميل وفقدان الاتصال بالإنترنت أثناء تحميلها يمكن أن يؤدي إلى فشل التحميل.
2- قد تواجه البعض صعوبة في التنقل في البرنامج وفهم كيفية استخدامه بسبب واجهة المستخدم المعقدة بعض الشيء.
3- قد يكون هناك بعض الميزات المفقودة التي يحتاجها المستخدمون في برنامج نابستر، مما يجعلهم ينتقلون إلى برامج أخرى.
4- قد يواجه بعض المستخدمين صعوبة في مشاركة الملفات بين الأجهزة المختلفة ، خاصة إذا لم يكونوا على اتصال دائم بالإنترنت.
5- قد يكون السعر مرتفعًا قليلاً لبعض المستخدمين المنفردين والشركات الصغيرة.