يمكن أن تكون هناك عدة عيوب في الدراسات الاستطلاعية الرقمية، بما في ذلك:
1- عدم تمثيلية العينة: يمكن للدراسات الاستطلاعية الرقمية أن تعاني من عدم تمثيلية العينة ، حيث يتم اختيار عينة من الجمهور المستهدف دون مراعاة التفاوت في الخصائص الديموغرافية والاجتماعية والاقتصادية والجغرافية والثقافية .
2- الاستجابة الواقعية: قد يؤدي الاعتماد على الدراسات الاستطلاعية الرقمية إلى عدم وجود استجابة واقعية من الأفراد ، حيث يمكن أن يتجاهل الكثير من الأفراد المشاركة في الاستطلاع أو يعطون إجابات غير صادقة.
3- التعامل مع البيانات الرقمية: يحتاج القائمون على الدراسات الاستطلاعية الرقمية إلى خبرة كبيرة في التعامل مع البيانات الرقمية وتحليل هذه البيانات. وقد تكون هذه العملية معقدة للغاية ، وتحتاج إلى وقت وجهد كبيرين.
4- العلاقة بين المتغيرات: قد يكون من الصعب في بعض الأحيان فهم العلاقة الحقيقية بين المتغيرات ، وخاصة عندما تعتمد الدراسات الاستطلاعية الرقمية على الاستنتاجات الإحصائية التي تعتمد على العلاقات الإحصائية وليس العلاقات السببية .