هناك العديد من طرق المراقبة المالية التي يمكن للمؤسسات استخدامها، ومن أهمها:
1- الميزانية السنوية: وهي عملية تخطيط المؤسسة للمدخولات والمصروفات على مدار السنة، ويتم متابعة تنفيذ الميزانية بشكل دوري.
2- التقارير المالية: وهي تقارير توضح كافة الحركات المالية في المؤسسة، بما في ذلك الدخل والمصروفات والديون والأصول والمخزون والربح.
3- المراجعة الداخلية: وهي عملية تقوم بها فريق داخلي من المراقبين الماليين، ويهدف الفريق إلى التأكد من صحة ودقة جميع الحركات المالية في المؤسسة.
4- المراجعة الخارجية: وهي عملية تتم بواسطة شركات مراجعة خارجية متخصصة، ويتم تقييم كافة العمليات المالية في المؤسسة وإعطاء تقرير بخصوصها.
5- نظم المراقبة المالية الأوتوماتيكية: وهي نظم تستخدم تقنية الحوسبة والذكاء الاصطناعي، والتي تقوم بتحليل الحركات المالية بصورة تلقائية ودقيقة، وتنبيه المسؤولين في المؤسسة في حالة وجود أي اختلالات في الحسابات أو الرواتب أو الإنفاق.