تعتبر محافظة نينوى منطقة تاريخية غنية وتضم العديد من المواقع التاريخية المهمة، ومن أبرزها:
1. المدينة القديمة لنينوى: تحتوي على آثار قصور الملك الآشوري سنحريب وآثار مدينة دور شريكين وأيضاً آثار المكتبة الملكية.
2. آثار قرية كويونجيق: تعود للحضارة الآشورية وتحتوي على بقايا قلعة وعدة منشآت مهمة.
3. قلعة الحمدانية: تعتبر واحدة من أشهر القلاع العثمانية في نينوى وتضم العديد من الممرات والشرفات والأسوار.
4. موقع حلبجة الأثري: يعود للحضارة الكلدانية ويضم العديد من المباني والقلاع القديمة.
5. قرية بكرجكي: حيث يوجد معبد الإله الآشوري نبراس الذي كان يستخدم في عمليات الأعمال الدينية.
6. مانيرة: يعود تاريخ مجمع مانيرا للأسر العثمانية ويضم بقايا العديد من المباني والحدائق.