تتضمن المعوقات التي قد تواجه عملية تطبيق التحريج في المؤسسات ما يلي:
1- عدم وجود رؤية واضحة للأهداف والاستراتيجيات التي يقوم عليها التحريج.
2- عدم توفر البيانات والمعلومات اللازمة لتنفيذ التحريج بفعالية.
3- عدم وجود فريق عمل مؤهل ومدرب على تقنيات التحريج وتحليل البيانات.
4- الاستثمار في تكنولوجيا التحريج وتحليل البيانات يتطلب تكلفة مرتفعة.
5- القلق بشأن الخصوصية والأمان والتشريعات القانونية المتعلقة بجمع وتحليل البيانات.
6- عدم الثقة في النتائج التي يتم الحصول عليها من تحليل البيانات.
7- قد يتم تجاهل بعض الجوانب الهامة في العملية التجارية بسبب التركيز العالي على تحليل البيانات.