يمكن أن تواجه مؤسسات الأوراق المالية عدة مخاطر، منها:
1- مخاطر السوق: وهي المخاطر المتعلقة بتقلبات الأسعار في الأسواق المالية وتغيرات العوامل الاقتصادية والسياسية والاجتماعية.
2- مخاطر الائتمان: وهي المخاطر المرتبطة بتعرض المؤسسات للخسارة في حالة عدم قدرتها على سداد الديون المستحقة عليها.
3- مخاطر التشغيل: وهي المخاطر المتعلقة بنشاط المؤسسات الاستثمارية وقدرتها على تحقيق أرباح مستمرة.
4- مخاطر القانونية: وهي المخاطر المتعلقة بتغريم المؤسسات أو العاملين فيها بسبب انتهاكهم للقوانين والتشريعات المالية.
5- مخاطر السياسية: وهي المخاطر المتعلقة بالتغييرات السياسية والاضطرابات الاجتماعية وتأثيرها على الأسواق المالية.