تجهيز التربة للزراعة العضوية يختلف عن الزراعة التقليدية في عدة جوانب:
1- استخدام المواد العضوية المستدامة: يتم استخدام المواد العضوية مثل السماد الحيواني والنباتي، والمخلفات الحيوانية والنباتية المتحللة، وذلك بدلاً من استخدام المبيدات الكيميائية الضارة والخطرة للبيئة.
2- تحسين التربة: تقوم الزراعة العضوية بتحسين صحة التربة، وذلك بإضافة المواد العضوية والخصوبة الطبيعية لها وبتقليل شدة الحرائق والتسممات الناجمة عن الزراعة التقليدية.
3- الحفاظ على التنوع البيولوجي: تضمن الزراعة العضوية إستدامة التنوع البيولوجي بالمحاكاة لبيئات الطبيعية الأصلية والمحلية بدلاً من تدميرها.
4- قدرة التربة: الزراعة العضوية تعطي الأولوية للاستدامة والقدرة الإنتاجية للتربة مدى الحياة حيث يتم الحفاظ على توازن النظام البيئي ومستوحى من بيئة الطبيعية\أمكانية استخدام التربة للزراعة المتكررة.
5- توفير الغذاء الصحي والآمن: الزراعة العضوية تعد آمنة وصحية لإنتاج الغذاء الصحي.