تواجه التجارة الداخلية العديد من العوائق، من بينها:
1. التعقيدات اللوجستية: تشمل تحميل وتفريغ البضائع وتخزينها ونقلها إلى الأماكن المناسبة.
2. قانونية: تشمل الرسوم الجمركية والتصاريح والتراخيص والضرائب وإجراءات الجمارك.
3. عدم الثقة بين الشركاء التجاريين: قد يؤدي عدم الثقة إلى عرقلة العمليات التجارية وتأخير التعاملات التجارية.
4. البيروقراطية: قد تكون هناك إجراءات بيروقراطية معقدة ومبالغ فيها تضيف عبئًا على الشركات وتسبب تأخيرًا في العمليات التجارية.
5. الاضطرابات السياسية: تشمل الاضطرابات الأمنية والاضطرابات الاقتصادية وتغيرات القوانين والتشريعات.
6. النقص في الموارد والتحيز الإقليمي: تشمل النقص في المواد الخام والمهارات والتركيز الإقليمي على بعض المناطق دون غيرها.
7. نقص البنية التحتية: الطرق والجسور والمطارات وغيرها من البنية التحتية الأساسية قد تكون غير كافية للدعم الكامل للتجارة الداخلية.