توجد العديد من الطرق المستخدمة في علم الأجنة لتحديد جنس الأجنة. ومنها:
1- فحص الصور الصوتية: يعتمد هذا النوع من الفحص على مدى تطور الأجنة ويمكن من خلالها تحديد الجنس في وقت متبكر جداً.
2- فحص الوحل: عندما يُخلط الوحل المأخوذ من الرحم بعد الإخصاب في مختبر مع مادة الصبغة ويتم تلوينها، فإن الخلايا التي تحتوي على الكروموسوم Y سوف تظهر باللون الأزرق في حين تظهر الخلايا التي تحتوي على الكروموسوم X باللون الأحمر.
3- فحص الدم: يتم فحص عينات الدم لتحديد نوع الصبغة الموجودة فيها، حيث يمكن تحديد الجنس بناءً على وجود أنواع محددة من الصبغات.
4- فحص الحمض النووي: هذا النوع من الفحص يتطلب جمع عينة من الأجنة، سواء من خلال الحصول على العينة مباشرة من الرحم أو بطريقة الانتحال الجنيني، ويتم تحليل الحمض النووي لتحديد الجنس.