هناك عدة صعوبات يمكن أن تواجه الشركات عند تحديث بيئات العمل باستخدام هندسة التصنيع والإنتاج، ومنها:
1- التكلفة: تحديث بيئات العمل بواسطة هندسة التصنيع والإنتاج يتطلب استثمارات مالية كبيرة لتجهيز المصانع وشراء المعدات والتكنولوجيا الحديثة.
2- الإجراءات القانونية: قد يتطلب تحديث بيئات العمل بواسطة هندسة التصنيع والإنتاج إجراءات قانونية معقدة مثل الحصول على تصاريح ورخص لتشغيل المعدات الجديدة والتدريب على استخدامها.
3- الموارد البشرية: قد تحتاج الشركات إلى تدريب موظفيها على العمل مع المعدات الجديدة، وهذا يتطلب استثمار الوقت والموارد في الإعداد والتدريب.
4- التكامل مع الأنظمة القديمة: قد يواجه المصنعون صعوبات في الجمع بين التقنيات الجديدة والأنظمة القديمة التي تستخدمها الشركة بنجاح.
5- التوافق مع المعايير العالمية: قد يكون من الصعب تحديث بيئة العمل لتتوافق مع المعايير العالمية، وخصوصًا الشركات الصغيرة والمتوسطة التي تفتقر إلى الموارد الكافية لتلبية هذه المعايير.