تواجه إدارة المصانع العديد من التحديات في الوقت الحاضر ، ومن أهم هذه التحديات:
1- نقص الموارد البشرية المؤهلة والمدربة.
2- ارتفاع تكاليف الطاقة والمواد الخام.
3- الضغط المتزايد على المصانع لتحسين الجودة والإنتاجية بشكل مستمر.
4- التشريعات واللوائح البيئية الصارمة والمتزايدة.
5- تغيرات سريعة في الأسواق والتكنولوجيا.
6- تزامن التحديات المالية والاقتصادية مع التحديات الفنية والتكنولوجية.
7- ضغوط المنافسة القوية وتحديات التغيير المستمر في السوق.