هناك العديد من الأنواع المختلفة من الكائنات الحية الوحيدة الخلية، ومنها:
1- البكتيريا: وهي كائنات حية وحيدة الخلية، وتعتبر من الأشكال الأولى للحياة على الأرض، وتوجد في الهواء والماء والتربة والجسم البشري والحيوانات.
2- الأميبا: وهي كائنات حية وحيدة الخلية، وتتحرك بواسطة أرجل وهمية، وتعيش في الماء والتربة.
3- الأكاريون: وهي كائنات حية وحيدة الخلية، وتتحرك بواسطة أشواك، وتعيش في الماء والتربة.
4- الدياتوم: وهي كائنات حية وحيدة الخلية، وتتحرك بواسطة الشعرات، وتعيش في الماء.
5- الطحالب: وهي كائنات حية وحيدة الخلية أو متعددة الخلايا، وتعيش في الماء أو الأرض.
6- الفطريات: وهي كائنات حية متعددة الخلايا، ولكن يوجد منها بعض الأنواع وحيدة الخلية، وتعيش في الأرض والماء وعلى الكائنات الحية.