تتضمن الأدوات والتقنيات الحديثة المستخدمة في الهندسة الصناعية الحيوية ما يلي:
1- تقنية التحريض المتزايد CRISPR/Cas9: تستخدم هذه التقنية للتلاعب بالجينات وتعديلها بشكل دقيق، مما يمكن من القيام بتصميم الأحياء بشكل جديد.
2- طباعة الأنسجة الحية: تستخدم هذه التقنية لإنتاج أنسجة حية معينة، التي يمكن استخدامها في التجارب المختلفة.
3- التحليل الحيوي للبيانات: تستخدم هذه التقنية لتحليل البيانات ذات الصلة بالهندسة الصناعية الحيوية، مما يساعد على تطوير دواء جديد أو طريقة علاجية جديدة.
4- السيطرة الروبوتية: تستخدم هذه التقنية لتنظيم الإنتاج الحيوي، والسيطرة على العمليات الحيوية المختلفة.
5- الآلات الحيوية: تمثل هذه التقنية إدخال الآلات الحديثة في مجال الهندسة الصناعية الحيوية، والتي تمكن من إنتاج منتجات حيوية متنوعة.