هناك عدة أدوات يمكن استخدامها لتحليل الجينات باستخدام الكيمياء الضوئية، ومنها:
1. النظائر المشعة: يمكن استخدام النظائر المشعة لوضع علامات مشعة على الجينات أو البروتينات. وبعد ذلك يتم قياس الإشعاع المشع لتحديد وجود أو كمية الجينات أو البروتينات.
2. الألوان المضادة: يمكن استخدام الألوان المضادة للتعرف على الجينات الموجودة في العينة. وعادة ما يتم استخدام ألوان مضادة تتفاعل مع الجين المستهدف وتغير لونها أو تصبح مشعة عند التفاعل مع الجين المراد تحليله.
3. التلوين الضوئي: يمكن استخدام الصبغات الضوئية لتلوين الجينات أو البروتينات ومن ثم قياس الامتصاص الضوئي لتحديد كمية الجينات أو البروتينات.
4. التفاعل الإنزيمي: يمكن استخدام التفاعل الإنزيمي للكشف عن الجينات أو البروتينات. وعادة ما يتم استخدام إنزيم يتفاعل مع الجين المستهدف أو البروتين ويعطي تفاعلاً يمكن قياسه بواسطة الكيمياء الضوئية.
5. التضخيم الضوئي: يمكن استخدام التضخيم الضوئي لزيادة قوة الإشارة المشعة من الجينات أو البروتينات الموجودة في العينة. ويتم ذلك عن طريق استخدام مواد مضادة مشعة أو ألوان مشعة تتفاعل مع الجين أو البروتين وتسبب تفاعلاً ضوئياً يمكن قياسه بدقة أكبر.