تعتمد الأثر البيئي للبحوث الميدانية على نوعية الأبحاث والمواقع التي يتم إجراؤها بها. يمكن أن يسبب إجراء البحوث الميدانية في مناطق بعيدة ومعزولة ضررًا على البيئة، على سبيل المثال بعض الأنشطة المتعلقة بتحليل تركيب الأرض يمكن أن تسبب ضررًا على التنوع الحيوي وتلوث المياه. وبالتالي فإن إجراء البحوث الميدانية بطريقة لا مسؤولة قد يؤثر سلباً على البيئة المحيطة بها.
من الجانب الآخر، يمكن أن تساهم بعض أنشطة البحث الميداني في رصد وتحليل التغيرات في المناطق الطبيعية والبيئية بطريقة تسمح باستخلاص الأدلة العلمية والحصول على المعلومات اللازمة لوضع استراتيجيات الحفاظ على البيئة والحفاظ على التنوع البيولوجي.
في النهاية، يجب على الباحثين أن يتبعوا ممارسات حماية البيئة المناسبة والتقنيات الحديثة للحد من الأثر البيئي لأنشطة البحث الميداني.