هناك عدة آليات فسيولوجية وراء الأزمات النفسية، ومنها:
1- نقص التوازن الكيميائي في المخ: حيث يؤدي اضطراب في مستويات الناقلات العصبية في المخ إلى زيادة خطر الإصابة بالأزمات النفسية.
2- التغيرات الهرمونية: حيث يؤدي اضطراب في التوازن الهرموني إلى زيادة خطر الإصابة بالأزمات النفسية، ومن الهرمونات التي تؤثر على الحالة النفسية هي هرمونات الإجهاد مثل الكورتيزول.
3- التغيرات الجينية: حيث يمكن أن يؤدي وجود بعض الجينات المرتبطة بالأزمات النفسية إلى زيادة خطر الإصابة بها.
4- التغيرات في النظام المناعي: حيث يؤدي اضطراب في النظام المناعي إلى زيادة خطر الإصابة بالأزمات النفسية، ومن الأمثلة على ذلك هو تفاعل بعض الأشخاص مع الإجهاد بتحفيز الالتهابات في الجسم.
5- العوامل البيئية: حيث يمكن أن تؤدي الصدمات النفسية والتجارب السلبية الأخرى إلى التغيرات الفسيولوجية التي تؤدي إلى الأزمات النفسية.