تسبب الشخير في الكثير من الآثار الفسيولوجية السلبية على الجسم، ومنها:
1- الإرهاق والخمول: يؤدي الشخير إلى الإرهاق والخمول الدائم بسبب اضطرار الإنسان للاستيقاظ بشكل متكرر خلال الليل.
2- التركيز الضعيف: يؤثر الشخير على قدرة الإنسان على التركيز والانتباه خلال اليوم.
3- الصداع: يعاني العديد من الأشخاص من الصداع المستمر بسبب الشخير الشديد.
4- زيادة خطر الإصابة بأمراض الجهاز التنفسي العلوي، مثل التهاب الحلق والزكام والربو.
5- النوم الغير مريح: يؤدي الشخير إلى نوم غير مريح وسط الأشخاص المحيطين، ويمنعهم من الحصول على نوم هادئ ومريح.
6- زيادة خطر الإصابة بأمراض القلب والأوعية الدموية، ومنها الجلطات الدموية والارتفاع في ضغط الدم.