تتضمن الآثار البيئية لعمليات تجهيز الأسماك والمحار ما يلي:
1- التلوث البيئي: تتسبب عمليات تجهيز الأسماك والمحار في إنتاج نفايات عضوية وصلبة تلوث الأرض والمياه وتؤثر على الثروات الحيوية المائية.
2- تدمير الأنظمة البيئية: يعتمد تجهيز الأسماك والمحار على صيد كبير للأسماك والمحار، مما يؤدي إلى تدمير الأنظمة البيئية في المناطق البحرية وخفض كمية الأسماك المتاحة.
3- إنتاج الطاقة الزائدة: يستخدم عمليات تجهيز الأسماك والمحار وقوداً عالي الكربون، وتستخدم الكثير من الطاقة والمياه لتنظيف الأسماك وصنع منتجاتها.
4- الآثار على الثقافة البيئية: تحتاج عمليات تجهيز الأسماك والمحار إلى معدات تكنولوجية متطورة مما يؤثر على التقاليد والثقافة المحلية لتجهيز الأسماك.