هناك العديد من البرامج المستخدمة في التحليل الرياضي المركب، وتشمل البرامج الشائعة:
1. MATLAB
2. R
3. Python (including libraries such as NumPy, SciPy, and pandas)
4. SAS
5. SPSS
6. STATA
7. Minitab
8. JMP
9. Excel (with data analysis add-ons)
10. Tableau
تختلف هذه البرامج في ميزاتها واستخداماتها، وتختار بناءً على نوع البيانات والتحليل المطلوب.