تختلف مواد الخام المستخدمة في هندسة الميكانيكا الحيوية وفقاً للتطبيقات المختلفة، لكن يتم استخدام المواد التالية بشكل شائع:
1- البلاستيك (Polymers):
تتميز بمرونة عالية مما يجعلها مناسبة للتطبيقات التي تتطلب تفاعل الخلية مع المادة.
2-المعادن (Metals):
تتميز المعادن بالقوة والصلابة والمرونة والاستقرار الكيميائي، وتستخدم على نطاق واسع في الأجهزة الطبية والزراعة.
3-السيراميك (Ceramics):
تعتبر السيراميك من المواد الصلبة التي تتميز بالصلابة والمقاومة للتآكل، ويستخدم في صناعة الأجهزة الطبية المختلفة.
4-المواد الطبيعية (Natural Materials):
يتم استخدام المواد الطبيعية مثل الأنسجة المحيطة بالعظام والأوعية الدموية والنسيج اليافي لصنع أجهزة طبية حيوية.
5- خليط من المواد (Composite Materials):
تتكون من مزيج من مواد مختلفة مثل البلاستيك والسيراميك والمعادن، وتستخدم في تصنيع الأجزاء التي تتعرض لجهود واسعة في الاستعمال.