توجد عدة أساليب لتشغيل الماكينات الخراطة وتشمل:
1- التحكم اليدوي: وهي الطريقة التقليدية التي تستخدم فيها العامل يدوياً عجلة التحكم لتشغيل الماكينة.
2- التحكم الرقمي: وهي الطريقة الحديثة التي يتم فيها استخدام برامج الكمبيوتر لتحديد الحركات التي تقوم بها الماكينة.
3- التحكم الهيدروليكي: وهي الطريقة التي تستخدم فيها القوة الهيدروليكية لتحريك الأجزاء الميكانيكية في الماكينة.
4- التحكم الهوائي: وهي الطريقة التي تستخدم فيها القوة الهوائية لتحريك الأجزاء الميكانيكية في الماكينة.