تتضمن أساليب التحكم في الآلات الميكاترونية عدة تقنيات ومنها:
1- التحكم الكهربائي: ويشمل البرمجة باستخدام لغات البرمجة المختلفة مثل Python وC++، لتطوير رموز التحكم اللازمة والتي تسمح بالتحكم في المحركات والمستشعرات والأجهزة الإلكترونية الأخرى.
2- التحكم الميكانيكي: وتتضمن التصميم الهندسي والتحليل الرياضي للحركة والقوى، وذلك لضمان تحريك الأجزاء الميكانيكية بشكل صحيح.
3- التحكم بالموجات: وهي تقنية تستخدم للتحكم بالموجات الكهرومغناطيسية كالصوت والأشعة تحت الحمراء والموجات اللاسلكية، وتسمح بالتحكم في الأجهزة والروبوتات في بيئات معقدة.
4- التحكم باستخدام المراقبة الذكية: وتستخدم هذه التقنية أنظمة المراقبة والتحكم لتحديد حالة النظام وتعديله بشكل دقيق، وذلك باستخدام الحواسيب والأنظمة الإلكترونية.