أدوات هندسة البروتينات هي عبارة عن مجموعة من التقنيات والأساليب الحديثة التي تستخدم في دراسة وتحليل وتعديل البروتينات. تشمل هذه الأدوات:
1- تقنية الكشف عالية النقاء
2- الترضيات الجزيئية
3- تقنيات التحول المشابه للمطعمات والمناعة، والتي تستخدم لتفصيل بولي ببتيدات والمضادات الحيوية.
4- تقنيات التحليل البلوري
5- تقنيات التحرير الجيني
6- تقنيات النمذجة الحاسوبية والتنبؤ.
