تطبيقات الحاسوب العلمية تشمل العديد من المجالات والتخصصات العلمية، منها:
1- الرسوم البيانية والتصميم الهندسي: حيث يستخدم الحاسوب لإنتاج الرسوم الهندسية والتصاميم ثلاثية الأبعاد.
2- الذكاء الاصطناعي: حيث يستخدم الحاسوب لتحليل البيانات وتحديد أنماط في سلوك الأنظمة والبشر.
3- النمذجة الرياضية: حيث يستخدم الحاسوب لصياغة نماذج رياضية للتنبؤ بالنظم والأحداث المختلفة.
4- تحليل البيانات و الإحصاء: حيث يستخدم الحاسوب لتحليل البيانات الإحصائية وتوليد التقارير.
5- الكيمياء الحاسوبية: حيث يستخدم الحاسوب لتصميم وتنبؤ خصائص المركبات الكيميائية المختلفة.
6- البيولوجيا الحاسوبية: حيث يستخدم الحاسوب لتحليل الجينوم وتحديد التشكلات الجينية والحسابية.
7- علوم المناخ والبيئة: حيث يستخدم الحاسوب لتصميم نماذج الطقس والتنبؤات البيئية المختلفة.