1- تخزين البيانات: حيث أن كمية البيانات الضخمة تتطلب تخزينا كبيرا، حيث يمكن أن يكون هذا التحدي مكلفا وصعبا.
2- تحليل البيانات: فالبيانات الضخمة تحتوي على كميات كبيرة من البيانات ولهذا يصعب التحليل لمعرفة المعلومات المفيدة.
3- الأمان: سمة البيانات الضخمة أنها تحمل معلومات حساسة، وبالتالي يجب تأمينها بأمان عالي للحفاظ عليها من القرصنة والاختراق.
4- سرعة البيانات: يصعب معالجة كمية البيانات الضخمة بشكل فعال وسريع إذا لم يتم استخدام أدوات وتقنيات كافية.
5- جودة البيانات: يمكن أن تتضمن البيانات الضخمة أخطاء أو اختلافات في الصيغ البيانية، وهذا يصعب على المستخدمين الاعتماد على البيانات المستخدمة في صنع القرارات أو اتخاذ الإجراءات.