تعتبر آفاق علم الأحياء في الأعماق البحرية العميقة مثيرة للاهتمام للعلماء بسبب الكثير من المعرفة الجديدة التي يمكن اكتشافها في هذه المناطق التي لا تزال غير مستكشفة بشكل جيد. ومن بين الآفاق التي يمكن تحقيقها في علم الأحياء البحرية العميقة:
1- اكتشاف أنواع حيوانات ونباتات جديدة، حيث يشتهر الأعماق البحرية بوجود أنواع لا يمكن العثور عليها في أي منطقة أخرى في العالم.
2- فهم النظام الإيكولوجي في تلك المناطق، حيث توجد سلاسل غذائية خاصة ونظام إيكولوجي فريد لا يمكن العثور عليه في أي مكان آخر في الأرض.
3- فهم مدى تأثير التغيرات المناخية على الحيوانات والنباتات في تلك المناطق، حيث يعتبر الصمت البحري العميق أحد الأنظمة الأكثر حساسية للتغيرات في درجة الحرارة ومستويات الملوحة.
4- دراسة القوى الطبيعية، مثل التسونامي والبراكين البحرية وما إلى ذلك، الذي يؤثر على الحياة في الأعماق البحرية العميقة.
ومن المهم الإشارة إلى أن التقنيات التي تستخدم في الغوص العميق ما زالت تواجه العديد من التحديات، وكذلك قلة الموارد المالية والمادية المتاحة لهذا النوع من البحوث، مما يجعل من الصعب الحصول على الكثير من المعلومات عن الحياة في الأعماق البحرية العميقة.