يمكن تحديد الجماجم القديمة من خلال دراسة هياكلها بعدة طرق، ومنها:
1- العمر الجيولوجي: يتم تحديد العمر الجيولوجي للجمجمة من خلال تحليل الصخور والأرضيات المحيطة بها.
2- التحليل الجيني: يتم تحديد العمر الجيني للجمجمة من خلال تحليل المادة الوراثية الموجودة فيها.
3- الحجم والشكل: يمكن تحديد العمر التقريبي للجمجمة من خلال حجمها وشكلها، حيث تختلف الجماجم القديمة عن الحديثة من حيث الحجم والشكل.
4- العلامات الأثرية: يمكن تحديد العمر التقريبي للجمجمة من خلال العلامات الأثرية الموجودة عليها، مثل الخدوش والتشققات، والتي تكون نتيجة للتآكل الطبيعي أو الإنساني.