تختلف العلوم البحت عن العلوم التطبيقية بأن العلوم البحت تهتم بالتحليل والفهم الأساسي للظواهر والمفاهيم والمعارف، بينما العلوم التطبيقية تركز على تطبيق هذه المفاهيم والمعارف في حل المشكلات العملية وتطوير التقنيات والمنتجات. وأهم الإختلافات بين العلوم البحت والعلوم التطبيقية كالتالي:
1- الهدف: يهدف العلم البحت إلى فهم الظواهر والمفاهيم والمعارف، بينما يهدف العلوم التطبيقية إلى تطبيق هذه المفاهيم والمعارف في حل المشكلات العملية.
2- الطريقة: تستخدم العلوم البحت طرائق البحث الأساسية مثل القياسات والتجارب والنظريات، بينما تستخدم العلوم التطبيقية طرائق البحث العملية مثل التجارب والتطبيقات العملية والاختبارات.
3- النتائج: تنتج العلوم البحت معرفة وفهم جديد للعالم ، بينما تنتج العلوم التطبيقية منتجات وتقنيات جديدة وتحسينات على المنتجات القائمة.
ويمكن القول بأن العلوم البحت تسعى إلى فهم العالم من حولنا ، فيما تسعى العلوم التطبيقية إلى تحسين المجتمع بتطوير تقنيات وحلول تمكننا من العيش بشكل أفضل.