يتم تنفيذ برنامج التحكم الآلي باستخدام مجموعة من الخطوات التالية:
1- تقوم الشركات المنتجة للمعدات والآلات بتصميم أنظمة التحكم الآلي وبرامجها.
2- يقوم المبرمج بتصميم البرنامج المناسب للتحكم في العمليات التي يريدها العميل.
3- يتم برمجة المتحكم الآلي باستخدام لغة البرمجة المناسبة.
4- يتم تحميل البرنامج الذي تم برمجته على المتحكم الآلي.
5- يتم فحص واختبار المتحكم الآلي قبل التشغيل الفعلي.
6- يتم تركيب المتحكم الآلي والتأكد من توصيله بالمعدات والآلات وفقًا للتعليمات الموجودة.
7- يتم تشغيل المتحكم الآلي والتأكد من عمله بشكل صحيح، كما يقوم المشغلون بمراقبة النظام باستمرار وتطبيق الصيانة الدورية عليه.