هناك عدة طرق لتدمير النظائر المشعة بأمان، وتختلف الطريقة المستخدمة حسب نوع النظائر المشعة وكميتها وموقعها. ومن أهم الطرق:
1- التحلل الإشعاعي: حيث يتم ترك النظائر المشعة حتى يتحلل الإشعاع الذي ينبعث منها على مدار فترة طويلة وحتى تصل إلى مستوى أمان من عدم الإشعاع.
2- الحرق: حيث يتم التخلص من النظائر المشعة بحرقها في أفران خاصة تعمل على درجات حرارة عالية، وتتضمن هذه الطريقة تأمين إجراءات السلامة والأمان المناسبة.
3- التحول الكيميائي: حيث يتم تحويل النظائر المشعة إلى نظائرٍ غير مشعة عند خلطها مع مركبات كيميائية محددة.
4- التخزين الدائم: حيث يتم تخزين النظائر المشعة في مكان خاص، مثل مستودعات النفايات الإشعاعية، وذلك بطرق تضمن عدم التسرب الإشعاعي والتأكد من تأمينها على المدى البعيد.