تختلف طريقة اتخاذ القرارات في الكنيسة من طائفة لأخرى ومن دولة إلى أخرى، لكن هناك بعض الطرق الشائعة التي قد تستخدم في الكنيسة، ومنها:
1- الاجتماعات الرسمية: يتم عقد اجتماعات رسمية لمناقشة الأمور المختلفة واتخاذ القرارات المناسبة. ويشارك في هذه الاجتماعات أعضاء هيئة الرعاة والمشرفين وأعضاء المجالس المختلفة ورؤساء الكنائس والمؤمنين.
2- الحوار والمناقشة: قد يتم عقد حوارات ومناقشات بين رؤساء الكنائس والمشرفين والأعضاء المؤثرين للتوصل إلى قرارات مناسبة.
3- التصويت: في بعض الكنائس، يتم عقد الانتخابات والتصويت على القرارات المختلفة، وكثيرًا ما تكون هذه العمليات بطريقة سرية.
4- الاستشارة: يمكن للكنيسة الاستشارة برأي الخبراء في مجالات معينة، مثل الشؤون القانونية، الصحية والإدارية.
5- الإلهام: تعتقد بعض الطوائف أن الأمور المصيرية يجب أن تتخذ وفقا للإلهام الإلهي والقراءة في الأوامر الكتابية.
في المجمل، تتم ممارسة القرارات في الكنيسة من خلال مزيج من الحوار، التفاوض والتصويت، وبعد تدقيق الأمور بكامل الدقة.