لقد حافظت هذه الكنائس على مر الزمن بفضل الجهود التي بذلها الناس للحفاظ عليها وصيانتها عبر العصور. ومن بين الأساليب التي استخدمت للحفاظ على هذه الكنائس هي:
1- الصيانة المنتظمة وإصلاح أي تلف فيها.
2- الاهتمام بالتراث الثقافي والتاريخي والديني المحيط بالكنائس والحفاظ عليه.
3- تحويل بعض الكنائس إلى متاحف أو محطات للسياحة لتشجيع الزوار وجذب الاهتمام بها.
4- تشجيع المصلين والزوار على المشاركة في المناسبات الدينية التي تقام في هذه الكنائس.
5- الحفاظ على الزخارف والرسومات المعمارية الخاصة بتلك الكنائس وعدم التراخي في الحفاظ عليها.
6- استخدام التكنولوجيا الحديثة للحفاظ على الكنائس مثل تحليل الأضرار الهيكلية وإجراء الصيانة اللازمة بسرعة.
7- وضع الكنائس تحت الحماية القانونية للحفاظ عليها من التدمير أو الاستغلال الخاطئ في المستقبل.