تختلف الرياضيات البحتة عن الرياضيات التطبيقية في طبيعة استخدامهما وأغراضهما. في الرياضيات البحتة، يتم التركيز على تطوير نظريات ومفاهيم رياضية جديدة وفهم خصائصها وخصائص علاقاتها بين بعضها البعض. بينما في الرياضيات التطبيقية، يتم استخدام الرياضيات لحل مشاكل وتطوير نماذج لتفسير وتوقع الظواهر الطبيعية والاجتماعية والاقتصادية.
ومن المهم أن نلاحظ أن الرياضيات البحتة والرياضيات التطبيقية لا تعملان على نحو مستقل بمعزل عن بعضهما البعض، بل يتم تطبيق الأفكار والنظريات الرياضية البحتة في الرياضيات التطبيقية لتطوير نماذج وحل المشاكل المختلفة. لذلك، تتكامل الرياضيات البحتة والتطبيقية في العديد من المجالات المختلفة.
