لغة البرمجة التي تُعرف بـ “PHYLIP” هي في الأساس ليست لغة برمجة في المفهوم التقليدي، بل هي تنسيق ملف يستخدم في مجال علم الأحياء الحوسبي لتخزين توازي متعدد لسلاسل الحمض النووي. تم تعريف هذا التنسيق أصلاً واستخدامه في حزمة PHYLIP التي طورها جو فلسنستاين (Joe Felsenstein) [1]. يتمثل الغرض الرئيسي لهذا التنسيق في تخزين معلومات التوازي بطريقة مألوفة وقابلة للقراءة من قبل البرامج والأدوات المختلفة في مجال علم الأحياء الحوسبي.
يتألف ملف PHYLIP عادة من مجموعة من السلاسل النووية المترابطة، معلنة بتنسيق يسمح بتمثيل هذه البيانات بشكل محدد. يمكن أن يحتوي الملف أيضًا على بيانات إضافية مثل الأسماء والعناوين والتعليقات، مما يسهل فهم المحتوى وتحليله للباحثين في مجال علم الأحياء الحوسبي.
بالرغم من أنه لا يوجد معلومات محددة حول المطورين أو مواقع الويب أو مستودعات GitHub المتعلقة بـ PHYLIP، إلا أنه يُعتبر تنسيقاً قياسياً مدعوماً من قبل عدة أدوات وبرامج في مجال علم الأحياء الحوسبي.
ملفات PHYLIP تتمتع ببعض السمات المميزة، مثل وجود تعليقات للتوثيق والتوضيح داخل الملف، وتنسيق محدد للتعليقات يسهل قراءتها وتفسيرها. كما يتميز التنسيق بالتنسيق الجمالي الذي يُسهل فهمه وتحليله، حيث يتم استخدام التباعد البصري لتنظيم البيانات بشكل مفهوم، مما يسهل تصحيح الأخطاء وتحليل النتائج.
بشكل عام، يُعتبر PHYLIP تنسيقًا مهمًا في مجال علم الأحياء الحوسبي، حيث يُستخدم في تبادل البيانات وتخزينها بشكل فعال وقابل للتحليل من قبل مختلف البرامج والأدوات المتوفرة في هذا المجال.
[1] Joe Felsenstein, “PHYLIP (Phylogeny Inference Package)”, University of Washington, [Online]. Available: https://evolution.genetics.washington.edu/phylip.html