تعتمد نظرية الهندسة المعمارية الإندونيسية على فلسفة “تسامح الأساليب” وهي فلسفة تهدف إلى إيجاد توازن مثالي بين التراث الثقافي والتقنيات الحديثة في التصميم المعماري. يتميز التصميم الإندونيسي بالتكامل بين المباني والطبيعة المحيطة بها، ويعتمد على استخدام المواد الطبيعية المتاحة محلياً مثل الخشب والحجر والطوب الطيني في تشكيل الهياكل والتفاصيل الزخرفية. كما يعتبر التصميم الإندونيسي فناً وأسلوباً متعدد الأبعاد يدمج تأثيرات الثقافات المختلفة التي تأثرت على المنطقة عبر العصور.