تشمل مواضيع البحوث الحالية في علم النباتات اللاوعائية عدة مجالات، منها:
1- تحليل التنوع الوراثي والتطور الجيني للنباتات اللاوعائية، والذي يتضمن دراسة علاقات الأجناس والأنواع والمورفولوجيا والتشريح.
2- تحديد مواقع نمو النباتات اللاوعائية وتأثير الظروف المحيطة عليها وكيفية التكيف مع هذه الظروف، والتي تشمل دراسة الإجهادات البيئية مثل التصحر والتلوث وتغير المناخ.
3- دراسة تأثير المواد الكيميائية والنباتية على النمو والتطور والتكاثر للنباتات اللاوعائية وفهم آليات العمل لهذه المواد.
4- تحليل العلاقات بين النباتات اللاوعائية والكائنات الحية الأخرى في البيئة المحيطة بها، مثل الفطريات والبكتيريا والحيوانات، ودراسة تأثير هذه العلاقات على نمو وتطور النباتات.
5- تطوير تقنيات جديدة لإنتاج وتكاثر النباتات اللاوعائية، والتي تشمل استخدام التكنولوجيا الحيوية وتقنيات الهندسة الوراثية والتكاثر الاصطناعي.
6- دراسة النباتات اللاوعائية الجديدة والنادرة والمهددة بالانقراض، وحماية هذه الأنواع وتحفيز الحفاظ عليها في الطبيعة وفي حدائق النباتات والمتاحف.
7- استخدام النباتات اللاوعائية في الصناعات المختلفة، مثل البحث عن مركبات جديدة للاستخدام في الأدوية والكيماويات والأغذية والمشروبات.