يتم تمويل المحاسبة الحكومية من العديد من المصادر، بما في ذلك:
1- الميزانية العامة للدولة: وهي الأموال التي يتم جمعها من الجمهور وتحويلها إلى الحكومة لتسخيرها في تقديم الخدمات الحكومية المختلفة، بما في ذلك المحاسبة والرقابة المالية.
2- الأموال المقدمة من مؤسسات التمويل الدولية: وتشمل البنك الدولي، وصندوق النقد الدولي، والاتحاد الأوروبي، ومؤسسات التمويل الإقليمية الأخرى التي تقدم دعماً للدول فيما يتعلق بالمحاسبة الحكومية.
3- التبرعات: وتتلقى الدول أحياناً تبرعات من مؤسسات خيرية، أو بلدان أخرى التي تدعم التنمية في دول أخرى، ويمكن استخدام هذه التبرعات في تمويل المحاسبة الحكومية.
4- القروض: وتتعاقد الدول في بعض الأحيان على القروض مع مؤسسات التمويل الدولية والمحلية، ويتم تخصيص جزء من هذه القروض لتمويل المحاسبة الحكومية.
5- الإيرادات الحكومية الأخرى: والتي تتضمن الرسوم والضرائب والإيرادات الأخرى التي تجمعها الحكومة من الأفراد والشركات.
6- المنح الحكومية: وتقدم الدول منحاً للمؤسسات الحكومية ومراكز البحوث والجامعات والمجتمع المدني لتمويل مشاريع محددة، ويمكن استخدام جزء من هذه المنح في تمويل المحاسبة الحكومية.