تواجه إندونيسيا العديد من المشاكل الاقتصادية، من بينها:
1- ارتفاع معدلات البطالة والفقر.
2- نمو الدين العام وضعف الاستثمارات، مما يؤدي إلى تراجع النمو الاقتصادي.
3- تأثير العوامل الخارجية، مثل تقلبات أسعار النفط والمنتجات الأساسية، وتغيرات سياسات التجارة الدولية، وأزمات الديون العالمية.
4- ضعف الهيكل التحتي للبنية التحتية، وقلة الاستثمارات في هذا المجال.
5- مشاكل بيئية، مثل التلوث والتغيرات المناخية، والتي تؤثر على القطاعات الزراعية والصناعية.
6- عدم التوزيع العادل للثروة والفرص في البلاد، مما يزيد من التوترات الاجتماعية والاقتصادية.