تتسبب الفيضانات في الكثير من المشاكل والمخاطر، من بينها:
1- خسارة الأرواح: تتسبب الفيضانات في العديد من الوفيات نتيجة للغرق، ونتيجة لحوادث الطرق الناجمة عنها.
2- الأضرار المادية: تتسبب الفيضانات في الكثير من الأضرار المادية، وتشمل ذلك تلف الممتلكات، والمرافق العامة، والطرق، والجسور.
3- تلوث المياه: تتسبب الفيضانات في تلوث المياه بشكل كبير، مما يؤدي إلى تلف البيئة والحياة البرية.
تتعامل هندسة التربة المائية مع الفيضانات عن طريق تصميم وإنشاء أنظمة الصرف الصحي والبنية التحتية والتصرف في المياه السطحية بطريقة تقلل من تأثير الفيضانات. ويتم ذلك عن طريق تحديد مناطق الفيضانات المحتملة وتصميم شبكات الصرف الصحي والتصرف في المياه السطحية بطريقة تدفع المياه بعيدًا عن المناطق المأهولة بالسكان. كما يتم تصميم السدود والحواجز لتقليل خطر الفيضانات وحماية المناطق الحيوية والمنازل.