هناك عدة مخاطر للطقس في الملاحة الجوية، ومنها:
1- الرياح القوية: يمكن أن تؤثر الرياح القوية على طائرة وتجعل من الصعب على الطيارين الحفاظ على استقرارها في الجو.
2- العواصف الرعدية: قد تتسبب العواصف الرعدية في تعطل أجهزة الطائرة وتشويش الاتصالات بين الطائرة وبرج المراقبة الجوية.
3- الضباب: يمكن أن يؤدي الضباب إلى تقليل الرؤية وجعل من الصعب على الطيارين الاستدلال على الاتجاه الصحيح.
4- الثلوج والأمطار الغزيرة: قد تؤثر الثلوج والأمطار الغزيرة على الطائرة وتجعل من الصعب على الطيارين الحفاظ على استقرارها في الجو.
5- التورنادو: يمكن أن يؤثر التورنادو على الطائرة وتجعل من الصعب على الطيارين السيطرة عليها في الجو.