تتميز الزراعة العضوية بعدة فوائد في تحسين جودة التربة، ومن أهم هذه الفوائد:
1- الحفاظ على التربة وعدم تدهورها بفعل استخدام المبيدات الكيميائية والأسمدة الصناعية الضارة.
2- زيادة نشاط الميكروبات في التربة، وهي المسؤولة عن تحليل المواد الغذائية وتحويلها إلى صورة يمكن للنبات أن يستخدمها.
3- زيادة تركيز المواد العضوية في التربة مما يساعد في تحسين خصوبتها وإنتاج المزيد من المحاصيل.
4- تحسين جودة الهواء والمياه، حيث يتم تقليل كمية المواد الكيميائية السامة التي تنتج عند استخدام الأسمدة والمبيدات الكيميائية.
5- تقليل الإجهاد البيئي على التربة والبيئة بشكل عام، حيث يتم توفير توازن أفضل بين التربة والنباتات المزروعة والبيئة المحيطة.