البرمجة الهيكلية توفر العديد من الفوائد، منها:
1- السهولة والبساطة: حيث يتم تقسيم البرنامج إلى عدة وظائف أو وحدات صغيرة تسهل عملية الفهم والصيانة.
2- الكفاءة: حيث يمكن استخدام الوظائف المنفصلة في مكان آخر من البرنامج أو في برامج أخرى.
3- التركيز على الوظيفة: حيث يساعد التقسيم على تركيز المبرمج على وظيفة معينة دون التفكير بالجانب الآخر من البرنامج.
4- التسهيل في الصيانة: حيث يمكن تحديث الوحدات أو إعادة استخدامها بشكل مستقل دون التأثير على باقي البرنامج.
5- الاختبار السهل: حيث يمكن اختبار الوظائف المنفصلة بشكل مستقل، وبالتالي تقليل فرص الأخطاء في البرنامج.
6- توفير الوقت والجهد: حيث يمكن للمبرمجين كتابة الوحدات المنفصلة في وقت مختصر وبجهد أقل مما يتطلبه البرنامج ككل.