فروع علم التشريح النباتي تشمل:
1. التشريح الخارجي: يدرس الهيكل الخارجي للنباتات ويشمل الأجزاء الرئيسية مثل الجذع والأوراق والزهور والثمار والبذور.
2. التشريح الداخلي: يدرس الهيكل الداخلي للنباتات ويشمل الأنسجة والأعضاء الداخلية مثل الأوعية النباتية والأنسجة الإنباتية والأنسجة الباعثة على النمو.
3. التشريح التطوري: يدرس تطور الهياكل النباتية عبر الزمن وكيفية تطورها مع مرور الوقت.
4. التشريح الجزيئي: يدرس الهياكل الجزيئية للنباتات مثل البروتينات والأحماض النووية والمركبات الكيميائية الأخرى وكيفية تأثيرها على وظائف النبات.
5. التشريح البيئي: يدرس التكيفات التي تقوم بها النباتات للبيئة المحيطة بها وكيفية تأثير العوامل البيئية على هياكلها ووظائفها.