يمكن تحديد بعض العيوب المحتملة في نظم المعلومات المحاسبية المحوسبة:
1. نقص في الأمان: يمكن للمتسللين الدخول إلى نظام المعلومات المحاسبية واختراقه والعبث به.
2. تكلفة النظام: يمكن أن تكون تكلفة تطوير وصيانة نظام المعلومات المحاسبية المحوسبة باهظة الثمن وقد لا يمكنها تبرير الإنفاق الإضافي.
3. صعوبة التكيف: تتطلب النظم المحاسبية المحوسبة دائمًا التكيف مع المستجدات التكنولوجية والتغييرات في المتطلبات الرسمية، مما يمكن أن يشكل عبئًا على الشركات الصغيرة.
4. الخلل في البرمجيات: قد يحدث خلل في نظام المعلومات المحاسبية المحوسبة بسبب المشاكل التقنية أو البرمجية، مما يؤدي إلى خسارة البيانات أو تأخير المهام المحوسبة.
5. البيانات الغير صحيحة: يمكن للخطأ الإنساني أو الخطأ التقني أن يؤدي إلى تسجيل بيانات غير صحيحة في نظام المعلومات المحاسبية، مما يمكن أن يؤدي إلى اتخاذ قرارات خاطئة.