عيوب حل تمارين التشجير تتضمن ما يلي:
1- قد يتم حل التمارين بشكل آلي دون الحاجة إلى التفكير والتحليل الذي يعتبر أساسيًا في عملية التعلم.
2- قد يحصل الطلاب على النتائج دون فهم العلاقة بين المفاهيم المتعلقة بالتمارين، مما يؤدي إلى نقص في تطبيق الفهم النظري على المهارات العملية.
3- قد يكون الحل غير دقيق أو غير كافٍ لأن التمارين الأوتوماتيكية قد تغفل عن العناصر التي لا يمكن للحل الآلي اخذها بعين الاعتبار.
4- التمارين المتكررة قد تؤدي إلى الملل والملل الذي يمكن أن يؤثر على الحافز للتعلم والتطوير.